Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rdh16f1E9Q9P8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rdh16f1E9Q9P8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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