Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms