Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Hectd4E9Q2E4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms