Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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