Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms