Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms