Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms