Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms