Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms