Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim30cD3YVI9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms