Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfx8D3YU81 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx8D3YU81 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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