Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Gm17333C6EQI3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm17333C6EQI3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm17333C6EQI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm17333C6EQI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm17333C6EQI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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