Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Phf11bB4XVQ1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Phf11bB4XVQ1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Phf11bB4XVQ1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Phf11bB4XVQ1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Phf11bB4XVQ1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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