Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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