Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc2B2RR83 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms