Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfx1B1AY10 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms