Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930402K13RikB1AW18 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms