Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms