Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms