Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms