Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms