Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fscn3Q9QXW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fscn3Q9QXW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fscn3Q9QXW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms