Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13Q9D777 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnfsf13Q9D777 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf13Q9D777 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms