Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Rpap3Q9D706 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap3Q9D706 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpap3Q9D706 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms