Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D454 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D454 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D454 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D454 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D454 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D454 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D454 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D454 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D454 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D454 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D454 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D454 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D454 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D454 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D454 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D454 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D454 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D454 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D454 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D454 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D454 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D454 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D454 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D454 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D454 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D454 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D454 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D454 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D454 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D454 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D454 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D454 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D454 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D454 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D454 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D454 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D454 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D454 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D454 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D454 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D454 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D454 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D454 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D454 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D454 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D454 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D454 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D454 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D454 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D454 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D454 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D454 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D454 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D454 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D454 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D454 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D454 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms