Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NkapQ9D0F4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NkapQ9D0F4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NkapQ9D0F4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NkapQ9D0F4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.5 ms