Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrabdQ99JY4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrabdQ99JY4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms