Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E130116L18RikQ8BMV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E130116L18RikQ8BMV6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E130116L18RikQ8BMV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms