Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem260Q8BMD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem260Q8BMD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmem260Q8BMD6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem260Q8BMD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms