Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4cQ811C2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4cQ811C2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4cQ811C2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4cQ811C2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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