Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stkld1Q80YS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stkld1Q80YS9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stkld1Q80YS9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stkld1Q80YS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms