Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vtcn1Q7TSP5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vtcn1Q7TSP5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vtcn1Q7TSP5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms