Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubfd1Q78JW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubfd1Q78JW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubfd1Q78JW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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