Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga3Q6NZL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga3Q6NZL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Soga3Q6NZL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms