Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sos1Q62245 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sos1Q62245 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sos1Q62245 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sos1Q62245 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms