Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cyb561Q60720 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyb561Q60720 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cyb561Q60720 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms