Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp13a3Q5XF89 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Atp13a3Q5XF89 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp13a3Q5XF89 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp13a3Q5XF89 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms