Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc69Q3TCJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms