Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt80Q0VBK2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt80Q0VBK2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms