Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc4Q08624 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc4Q08624 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc4Q08624 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms