Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ly9Q01965 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly9Q01965 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ly9Q01965 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly9Q01965 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms