Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RykQ01887 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RykQ01887 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RykQ01887 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RykQ01887 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RykQ01887 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RykQ01887 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RykQ01887 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RykQ01887 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RykQ01887 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RykQ01887 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RykQ01887 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RykQ01887 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RykQ01887 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RykQ01887 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RykQ01887 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RykQ01887 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RykQ01887 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RykQ01887 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RykQ01887 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RykQ01887 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RykQ01887 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RykQ01887 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RykQ01887 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RykQ01887 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RykQ01887 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RykQ01887 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RykQ01887 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RykQ01887 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RykQ01887 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RykQ01887 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RykQ01887 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RykQ01887 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RykQ01887 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RykQ01887 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RykQ01887 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RykQ01887 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RykQ01887 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RykQ01887 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RykQ01887 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RykQ01887 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RykQ01887 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RykQ01887 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RykQ01887 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RykQ01887 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RykQ01887 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RykQ01887 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RykQ01887 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RykQ01887 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RykQ01887 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RykQ01887 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RykQ01887 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RykQ01887 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RykQ01887 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RykQ01887 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RykQ01887 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RykQ01887 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RykQ01887 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RykQ01887 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RykQ01887 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms