Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga4Q00651 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itga4Q00651 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms