Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmsP97355 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmsP97355 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmsP97355 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmsP97355 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SmsP97355 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmsP97355 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SmsP97355 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmsP97355 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SmsP97355 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SmsP97355 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SmsP97355 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmsP97355 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmsP97355 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SmsP97355 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmsP97355 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmsP97355 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmsP97355 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SmsP97355 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmsP97355 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SmsP97355 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SmsP97355 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SmsP97355 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmsP97355 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmsP97355 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SmsP97355 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmsP97355 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmsP97355 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmsP97355 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SmsP97355 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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SmsP97355 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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SmsP97355 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SmsP97355 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmsP97355 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmsP97355 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmsP97355 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmsP97355 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmsP97355 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SmsP97355 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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SmsP97355 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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SmsP97355 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmsP97355 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SmsP97355 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmsP97355 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmsP97355 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmsP97355 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmsP97355 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmsP97355 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmsP97355 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms