Protein–RNA interactions for Protein: P70434

Irf7, Interferon regulatory factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf7P70434 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf7P70434 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf7P70434 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf7P70434 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf7P70434 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf7P70434 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf7P70434 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf7P70434 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf7P70434 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf7P70434 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf7P70434 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf7P70434 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf7P70434 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms