Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcmtd1P59913 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcmtd1P59913 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcmtd1P59913 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms