Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CitP49025 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CitP49025 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CitP49025 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CitP49025 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CitP49025 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CitP49025 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CitP49025 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CitP49025 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CitP49025 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CitP49025 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CitP49025 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CitP49025 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CitP49025 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CitP49025 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CitP49025 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CitP49025 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CitP49025 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CitP49025 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CitP49025 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CitP49025 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CitP49025 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CitP49025 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CitP49025 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CitP49025 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CitP49025 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CitP49025 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CitP49025 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CitP49025 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CitP49025 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CitP49025 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CitP49025 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CitP49025 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CitP49025 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CitP49025 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CitP49025 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CitP49025 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CitP49025 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CitP49025 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CitP49025 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CitP49025 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CitP49025 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CitP49025 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CitP49025 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CitP49025 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CitP49025 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CitP49025 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CitP49025 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CitP49025 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CitP49025 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CitP49025 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CitP49025 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CitP49025 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CitP49025 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CitP49025 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CitP49025 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CitP49025 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CitP49025 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CitP49025 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CitP49025 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CitP49025 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CitP49025 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CitP49025 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CitP49025 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CitP49025 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CitP49025 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CitP49025 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CitP49025 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CitP49025 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CitP49025 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CitP49025 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CitP49025 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CitP49025 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CitP49025 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms