Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
OatP29758 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
OatP29758 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
OatP29758 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
OatP29758 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
OatP29758 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
OatP29758 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
OatP29758 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
OatP29758 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
OatP29758 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
OatP29758 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
OatP29758 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
OatP29758 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
OatP29758 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
OatP29758 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
OatP29758 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
OatP29758 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
OatP29758 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
OatP29758 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
OatP29758 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
OatP29758 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
OatP29758 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
OatP29758 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
OatP29758 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
OatP29758 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
OatP29758 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
OatP29758 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
OatP29758 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
OatP29758 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
OatP29758 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
OatP29758 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
OatP29758 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
OatP29758 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
OatP29758 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
OatP29758 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
OatP29758 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
OatP29758 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
OatP29758 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
OatP29758 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
OatP29758 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
OatP29758 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
OatP29758 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
OatP29758 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
OatP29758 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
OatP29758 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
OatP29758 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
OatP29758 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
OatP29758 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
OatP29758 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
OatP29758 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
OatP29758 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
OatP29758 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
OatP29758 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
OatP29758 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
OatP29758 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
OatP29758 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
OatP29758 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
OatP29758 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
OatP29758 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
OatP29758 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
OatP29758 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
OatP29758 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
OatP29758 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
OatP29758 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
OatP29758 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
OatP29758 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
OatP29758 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
OatP29758 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
OatP29758 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
OatP29758 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
OatP29758 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,66
OatP29758 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
OatP29758 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
OatP29758 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,9 ms