Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myod1P10085 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myod1P10085 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myod1P10085 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myod1P10085 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myod1P10085 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms