Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf1P09925 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Surf1P09925 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf1P09925 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf1P09925 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf1P09925 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Surf1P09925 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Surf1P09925 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf1P09925 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf1P09925 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Surf1P09925 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf1P09925 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf1P09925 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf1P09925 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Surf1P09925 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf1P09925 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms